Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms