Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf9Q07105 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms