Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdf3Q07104 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms