Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cab39Q06138 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cab39Q06138 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms