Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top1Q04750 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1Q04750 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1Q04750 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1Q04750 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1Q04750 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1Q04750 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top1Q04750 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms