Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd1Q04519 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms