Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh1Q02576 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms