Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnnb1Q02248 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnnb1Q02248 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms