Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nme2Q01768 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms