Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms