Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sec23aQ01405 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms