Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms