Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms