Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Grin2bQ01097 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin2bQ01097 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms