Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms