Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F8a1Q00558 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms