Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms