Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms