Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmsP97355 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmsP97355 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmsP97355 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmsP97355 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmsP97355 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmsP97355 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmsP97355 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmsP97355 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmsP97355 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmsP97355 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmsP97355 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmsP97355 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmsP97355 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmsP97355 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmsP97355 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmsP97355 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SmsP97355 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmsP97355 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmsP97355 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmsP97355 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmsP97355 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmsP97355 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmsP97355 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SmsP97355 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmsP97355 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmsP97355 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmsP97355 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmsP97355 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmsP97355 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmsP97355 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmsP97355 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmsP97355 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmsP97355 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmsP97355 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmsP97355 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmsP97355 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmsP97355 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmsP97355 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmsP97355 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmsP97355 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmsP97355 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmsP97355 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmsP97355 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmsP97355 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmsP97355 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmsP97355 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmsP97355 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmsP97355 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmsP97355 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmsP97355 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmsP97355 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmsP97355 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmsP97355 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SmsP97355 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmsP97355 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmsP97355 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmsP97355 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmsP97355 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmsP97355 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmsP97355 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmsP97355 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmsP97355 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms