Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms