Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Arf1P84078 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Arf1P84078 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arf1P84078 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms