Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Otx2P80206 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Otx2P80206 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Otx2P80206 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Otx2P80206 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Otx2P80206 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Otx2P80206 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Otx2P80206 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Otx2P80206 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Otx2P80206 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Otx2P80206 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Otx2P80206 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Otx2P80206 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Otx2P80206 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Otx2P80206 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Otx2P80206 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Otx2P80206 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Otx2P80206 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Otx2P80206 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Otx2P80206 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Otx2P80206 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Otx2P80206 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Otx2P80206 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Otx2P80206 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Otx2P80206 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Otx2P80206 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Otx2P80206 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Otx2P80206 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Otx2P80206 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Otx2P80206 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Otx2P80206 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Otx2P80206 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Otx2P80206 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Otx2P80206 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Otx2P80206 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Otx2P80206 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms