Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms