Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smg6P61406 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg6P61406 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg6P61406 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg6P61406 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg6P61406 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg6P61406 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg6P61406 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg6P61406 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg6P61406 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms