Protein–RNA interactions for Protein: P60334

Cdo1, Cysteine dioxygenase type 1, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdo1P60334 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdo1P60334 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdo1P60334 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms