Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr3bP59470 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms