Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpaP58389 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpaP58389 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpaP58389 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpaP58389 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PtpaP58389 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpaP58389 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PtpaP58389 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PtpaP58389 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PtpaP58389 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PtpaP58389 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PtpaP58389 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PtpaP58389 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpaP58389 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpaP58389 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms