Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc12a1P55014 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc12a1P55014 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc12a1P55014 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc12a1P55014 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc12a1P55014 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc12a1P55014 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc12a1P55014 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc12a1P55014 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc12a1P55014 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc12a1P55014 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc12a1P55014 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc12a1P55014 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc12a1P55014 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms