Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Faf1P54731 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Faf1P54731 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Faf1P54731 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Faf1P54731 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Faf1P54731 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Faf1P54731 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Faf1P54731 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Faf1P54731 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Faf1P54731 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Faf1P54731 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Faf1P54731 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Faf1P54731 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Faf1P54731 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Faf1P54731 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Faf1P54731 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Faf1P54731 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Faf1P54731 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Faf1P54731 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Faf1P54731 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Faf1P54731 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Faf1P54731 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Faf1P54731 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Faf1P54731 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Faf1P54731 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Faf1P54731 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Faf1P54731 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Faf1P54731 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Faf1P54731 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Faf1P54731 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Faf1P54731 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Faf1P54731 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Faf1P54731 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Faf1P54731 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Faf1P54731 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Faf1P54731 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Faf1P54731 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Faf1P54731 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Faf1P54731 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Faf1P54731 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms