Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnfP51944 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnfP51944 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnfP51944 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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