Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms