Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TspoP50637 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TspoP50637 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TspoP50637 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TspoP50637 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TspoP50637 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TspoP50637 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TspoP50637 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TspoP50637 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TspoP50637 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TspoP50637 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TspoP50637 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TspoP50637 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TspoP50637 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TspoP50637 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TspoP50637 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TspoP50637 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TspoP50637 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TspoP50637 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TspoP50637 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TspoP50637 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TspoP50637 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TspoP50637 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TspoP50637 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TspoP50637 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TspoP50637 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TspoP50637 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TspoP50637 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TspoP50637 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TspoP50637 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TspoP50637 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TspoP50637 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TspoP50637 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TspoP50637 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TspoP50637 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TspoP50637 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TspoP50637 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TspoP50637 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TspoP50637 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TspoP50637 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TspoP50637 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TspoP50637 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TspoP50637 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TspoP50637 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TspoP50637 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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