Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc13P50207 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms