Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdhaP50136 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdhaP50136 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdhaP50136 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdhaP50136 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdhaP50136 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdhaP50136 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BckdhaP50136 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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BckdhaP50136 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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BckdhaP50136 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BckdhaP50136 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdhaP50136 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdhaP50136 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdhaP50136 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdhaP50136 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdhaP50136 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdhaP50136 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BckdhaP50136 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdhaP50136 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdhaP50136 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdhaP50136 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdhaP50136 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdhaP50136 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdhaP50136 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdhaP50136 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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BckdhaP50136 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BckdhaP50136 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BckdhaP50136 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BckdhaP50136 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BckdhaP50136 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BckdhaP50136 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BckdhaP50136 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BckdhaP50136 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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BckdhaP50136 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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BckdhaP50136 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdhaP50136 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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BckdhaP50136 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdhaP50136 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BckdhaP50136 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdhaP50136 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdhaP50136 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdhaP50136 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BckdhaP50136 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdhaP50136 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BckdhaP50136 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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BckdhaP50136 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdhaP50136 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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BckdhaP50136 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdhaP50136 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdhaP50136 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdhaP50136 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BckdhaP50136 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdhaP50136 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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