Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcd1P48410 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms