Protein–RNA interactions for Protein: P47964

Rpl36, 60S ribosomal protein L36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl36P47964 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl36P47964 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl36P47964 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl36P47964 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl36P47964 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl36P47964 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl36P47964 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl36P47964 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl36P47964 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl36P47964 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl36P47964 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl36P47964 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms