Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrprbP47758 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrprbP47758 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrprbP47758 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrprbP47758 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SrprbP47758 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms