Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf4P43488 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf4P43488 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms