Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh2P43247 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh2P43247 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh2P43247 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh2P43247 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh2P43247 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh2P43247 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh2P43247 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh2P43247 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh2P43247 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msh2P43247 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh2P43247 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh2P43247 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms