Protein–RNA interactions for Protein: P43006

Slc1a2, Excitatory amino acid transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a2P43006 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc1a2P43006 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc1a2P43006 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc1a2P43006 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a2P43006 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a2P43006 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a2P43006 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a2P43006 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a2P43006 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a2P43006 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a2P43006 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a2P43006 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a2P43006 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a2P43006 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a2P43006 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a2P43006 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a2P43006 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a2P43006 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a2P43006 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a2P43006 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a2P43006 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a2P43006 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a2P43006 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a2P43006 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc1a2P43006 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a2P43006 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a2P43006 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a2P43006 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a2P43006 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a2P43006 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc1a2P43006 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms