Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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