Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd1P40201 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd1P40201 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chd1P40201 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd1P40201 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd1P40201 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd1P40201 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd1P40201 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Chd1P40201 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd1P40201 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd1P40201 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd1P40201 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Chd1P40201 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms