Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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HmgclP38060 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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HmgclP38060 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189 ms