Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprkP35822 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprkP35822 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprkP35822 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PtprkP35822 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprkP35822 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprkP35822 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprkP35822 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprkP35822 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms