Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn1P35821 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms