Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms