Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms