Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb9P28076 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb9P28076 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms