Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2afxP27661 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2afxP27661 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2afxP27661 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2afxP27661 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2afxP27661 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
H2afxP27661 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2afxP27661 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms