Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ChgaP26339 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChgaP26339 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ChgaP26339 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChgaP26339 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChgaP26339 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChgaP26339 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms